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西红柿出现死棵的问题，可以用传统的化学农药灌根使用，这样能直接灭杀土壤中的病原菌，起效快，受到其他因素的影响较小，药效比较稳定，但是化学农药对枯萎病、青枯病等从毛细根上发生的根部病害防治不佳。也可以用生物菌剂灌根或冲施使用，起效慢，但持效期长，容易造成药效下降甚至失效，稳定性较差。
